燕巢分部啟用於2006年，醫學學群各學系已陸續遷入，與教學醫院「義大醫院」緊鄰，為將來成立醫學院預做準備。燕巢分部設有醫學學群、進修部，相關系所如下：
醫學學群(醫學院籌備中)：
| 系所科別 | 班別 |
| 生物醫學工程學系
(暫歸屬電機資訊學院) |
大學學士班、碩士班 |
| 醫務管理學系
(暫歸屬管理學院) |
大學學士班、碩士班 |
| 護理學系
(暫歸屬管理學院) |
大學學士班 |
| 物理治療學系
(暫歸屬理工學院) |
大學學士班 |
| 生物科技學系
(暫歸屬電機資訊學院) |
大學學士班、碩士班 |
| 醫學影像暨放射科學系
(暫歸屬電機資訊學院) |
大學學士班 |
| 職能治療學系
(暫歸屬理工學院) |
大學學士班 |
| 健康管理學系
(暫歸屬管理學院) |
大學學士班 |
| 醫學營養學系
(暫歸屬理工學院) |
大學學士班 |
| 學士後中醫學系
(暫歸屬理工學院) |
大學學士班 |
進修部：
| 系所科別 | 班別 |
| 護理學系 | 二年制在職專班 |
| 醫學影像放射科學系 | 二年制在職專班 |
地址：高雄市82445燕巢區角宿里義大路8號 (GoogleMap)
電話：(07) 6151100
分機表
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方法一：國道1 號楠梓交流道出口，沿旗楠公路 (台22線) 往旗山方向直行約 4.5 公里
方法二：國道1 號岡山交流道出口沿安招路往燕巢方向行駛至中興路右轉往楠梓方向前進即可順著角宿路(與中興路同一條) 抵達義守大學燕巢分部。
方法三：國道10號高速公路下燕巢交流道，直行穿過義大醫院院區即可抵達。
校園平面圖
